经重整后，目前驻港的台湾情报网主要架构有4站1组和多名“直属员”，人数约在40人左右。当中4站1组的“国防部”编号分别是“1100站”、“1269站”、“1319站”和“1042组”；全部归军情局第4处管辖。
《大公报》获得的消息指出，每站编制5人，均设站长、副站长，以及情报官(情报官主要由台湾人出任)，当中的站长未必一定受过特工训练，反而会选择长袖善舞人士，方便渗透不同类型的组织，实际的谍报工作会由受过长时间训练的副站长负责，以“1100”站为例，实际工作执行人为副站长苏紫萍，她的手下有2男1女情报官。
另“1042组”的编制为3人，专门负责传递机密信息、寄密函、调配物资，以及“敌后”单位的维护指导等。另外，有10多人为“直属员”，以个人为单位，直接向台湾军事情报局负责，当中有台湾人和香港土生土长人士。
这批在港工作的特务无论是站长、情报官，还是直属员，全部属军方编制，是正职军人，迄今人数约40人，他们除介入香港事务、制造混乱，部分情报官和“直属员”还负责收集中国内地情报，并按内地省市的划分，各有不同的专属区域。
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